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RT-PCR技术操作流程

RT-PCR技术操作流程

的有关信息介绍如下:

RT-PCR技术操作流程

RT-PCR是利用反转录酶催化dNTPs聚合成与mRNA模板互补的单链DNA(即cDNA),以cDNA为模板在PCR反应系统中进行扩增,然后通过琼脂糖凝胶电泳法检测RT-PCR产物,从而间接检测mRNA的方法。

DEPC处理水溶解RNA,-20℃保存,备反转录之用。

(1) 按下列组成调制反应液:

样品总RNA 1μg

随机引物或oligo­-dT(18-20) 100pmol

脱氧核苷三磷酸(每种dNTP各l0mmol/L) 1μl

反转录缓冲液(5×) 4μl

RNase 抑制剂 (20~40U/μl ) 1μl

M-MLV 反转录酶 20U

DEPC处理水 补至20μl

阴性对照用DEPC处理水代替RNA模板,其余成分相同。将上述反应成分加于0.5ml EP管中,混匀,短时离心。

(2) 将各反应管放入PCR扩增仪上,37℃ 60min,70℃变性15min。反转录产物于4℃保存备用。

(1)按下列组成调制反应液:

Taq DNA聚合酶 1.0U

cDNA模板 1.0μl

引物一对(各10pmol/μl) 1.0μl

脱氧核苷三磷酸(每种dNTP各2.5mmol/L) 2.0μl

PCR缓冲液(10×,含MgCl2) 2.5μl

双蒸水 补至25.0μl

以反转录阴性对照取代cDNA模板作为PCR阴性对照,将上述反应成分加于0.2ml PCR管中,短暂离心,混匀。

(2) 将各PCR反应管放入DNA扩增仪,94℃5min,然后按以下条件进行热循环:94℃ 45s、56℃30s、72℃30s,循环30次,最后72℃延伸10min。

取PCR产物8μl 与 上样缓冲液2μl混合上样,适当大小的DNA Marker 一起电泳分离,溴乙锭染色,图像分析仪摄像并分析结果。

1.1%琼脂糖凝胶电泳记录结果。与DNA Marker相比,观察被检样品管的扩增产物位置,如与预期大小一致,且空白对照管中无扩增条带,说明本实验获得的条带与预期靶片段大小相符。

2.此方法的优点是可以由少量的mRNA(从1~2个哺乳动物细胞提取的mRNA)构成cDNA文库,RT-PCR可使所需模板的mRNA量大大减少。因此,对于低丰度mRNA的cDNA克隆及cDNA文库的构建非常有利。